• Termociclador en tiempo real IQ5 (BioRad)
• Termociclador en tiempo final (TEKNE)
• Sistema de electroforesis automático Experion (BioRad)
• Sistema de purificación AKTA (GE Healthcare Life Sciences)
• Sistema de adquisición y documentación de imágenes MIniBis Pro (DNR)
• Nanofotómetro (IMPLEN)
• Centrífugas, incubadores, bloques térmicos, sistemas de electroforesis horizontales y verticales, cámara fría.

Publicaciones

• Safety and Efficacy of ApTOLL in Patients With Ischemic Stroke Undergoing Endovascular Treatment: A Phase 1/2 Randomized Clinical Trial. 2023. doi: 10.1001/jamaneurol.2023.1660..
• First-in-human phase I clinical trial of a TLR4-binding DNA aptamer, ApTOLL: Safety and pharmacokinetics in healthy volunteers. 2022. doi: 10.1016/j.omtn.2022.03.005
• Selection and characterization of DNA aptamers for highly selective recognition of the major allergen of olive pollen 2022. doi: 10.1016/j.aca.2021.339334.
• FPR2 DNA Aptamers for Targeted Therapy of Wound Repair. 2022. doi: 10.1016/j.jid.2021.12.026.
• Development of an antigen Enzyme-Linked AptaSorbent Assay (ELASA) for the detection of swine influenza virus in field samples. 2021. doi: 10.1016/j.aca.2021.338933.
• The Relevance of the SH2 Domain for c-Src Functionality in Triple-Negative Breast Cancer Cells. 2021. doi: 10.3390/cancers13030462.
• Novel DNA Aptamers against CCL21 Protein: Characterization and Biomedical Applications for Targeted Drug Delivery to T Cell-Rich Zones. 2018. doi: 10.1089/nat.2017.0689

La unidad trabaja activamente en proyectos de colaboración privada para:

• La selección e identificación de aptámeros frente a agentes infecciosos (Xylella fastidiosa, Botrytis cinérea), pépticos o células o mecanismos moleculares de distintas enfermedades.  
• Análisis de poblaciones de aptámeros secuenciadas mediante NGS.
• Estudios en preclínicos del aptámero
• Estabilidad de aptámeros in vitro.
• Estudios de unión de aptámeros a proteínas plasmáticas.
• Estudios del efecto de aptámeros en la formación de nanoesferas.

Patentes

• Aptámeros específicos de TLR-4 y usos de los mismos P201430955; PCT/EP2015/064277.
• MAFG AS a potential therapeutic target to restore chemosensitivity in platinum-resistant cancer cells. EP17382610 con PCTEP2018/06815 y extensión en USA 16/647,368 y Europa 18 734 266.2
• Aptamers against the hepatitis c virus core protein. EP21382710.8
• Aptameros y su uso en el tratamiento del cáncer. EP 18 382 888.8 con PCT/EP2019/083547
• Aptámeros agonistas del receptor FPR2 y usos de los mismos. P201930524 con PCT/ES2020/070378

**Consultar tarifas con la unidad

Selección de poblaciones de aptámeros específicos frente a la diana

Se seleccionarán poblaciones de aptámeros frente a una diana utilizando la metodología SELEX apropiada. Se realizarán hasta 12 rondas de selección. Se medirá el enriquecimiento de cada una de las poblaciones obtenidas tras las sucesivas rondas de selección. Se suministrará la población enriquecida en aptámeros que reconozcan la diana

Identificación mediante NGS y caracterización estructural in silico de aptámeros

Se secuenciará la población enriquecida en aptámeros frente a la diana, se analizará la estructura secundaría de los aptámeros identificados y se sintatizarán hasta 4 aptámeros representativos

Confirmación de la interacción y estudio de la afinidad por SPR (4 aptámeros)

Se confirmará la interacción de los aptámeros seleccionados y se estudiará la afinidad de los mismos sintetizados quimicamente mediante SPR. Se entregará la secuencia de los aptámeros que muestren mayor afinidad por la diana

Optimización de aptámeros

Se estudiará la estructura de los aptámeros y se diseñaran aptámeros modificados mediante la eliminación de secuencias que no alteren la estructura activa del mismo.

Estabilidad in vitro: 1. En plasma humano, rata y mono (NHP); 2. Estabilidad frente a nucleasas (λ-exonucleasa y DNAsa I)

Se confirmará la interacción de los aptámeros seleccionados y se estudiará la afinidad de los mismos sintetizados quimicamente mediante SPR. Se entregará la secuencia de los aptámeros que muestren mayor afinidad por la diana.

Toxicidad in vitro: evaluación de la citotoxicidad de los aptámeros mediante la cuantificación de MTT y LDH

Se evaluará la toxicidad de las muestras en cultivos celulares mediante cuantificación de MTT y LDH

Ensayos funcionales

Se realizarán estudios que permitan conocer la actividad agonista o antagonista de los aptámeros utilizando los modelos apropiados

Asesoría técnica y apoyo técnico

Asesoramiento relacionado con tecnología de aptámeros. Puesta a punto de nuevos protocolos. Formación e implementación de técnicas específicas. Soporte técnico y metodológico.