Proyecto AptaCOV. Aunque en las últimas décadas se han realizado muchos esfuerzos para desarrollar vacunas y/o agentes terapéuticos contra las infecciones producidas por coronavirus humano (CoV) como el MERS y el SARS, hasta la fecha, no existe un tratamiento antiviral específico para estas patologías. La mayoría de las investigaciones para desarrollar vacunas y medicamentos frente a CoV apuntan a la proteína S, principal inductor de anticuerpos neutralizantes e implicada en la interacción con receptores en la célula huésped. Los aptámeros son ácidos nucleicos de cadena sencilla que son capaces de plegarse en complicadas estructuras terciarias lo que les permite reconocer de forma específica y con alta afinidad a sus moléculas diana. Hasta donde se sabe, actualmente no existe una estrategia terapéutica frente a SARS-CoV2 basada en el desarrollo de aptámeros. Partiendo de todo ello, el equipo del Dr. VÍCTOR M. GONZÁLEZ, Responsable del Grupo APTÁMEROS (Área 4 del IRYCIS) y líder del proyecto AptaCOV, en colaboración con el Laboratorio de Epidemiología Molecular del VIH-1 del Grupo Biología y Evolución de Microorganismos (Área 2 del IRYCIS), están trabajando para seleccionar aptámeros frente a péptidos conservados en la proteína S y específicos de SARS-CoV-2, pero también frente a péptidos conservados en los distintos virus SARS-CoV-2 de la familia Coronaviridae, con el objetivo de obtener moléculas con potencial actividad terapéutica que permitan tratar a pacientes de COVID-19, pero también a personas que puedan resultar infectadas por otros virus de esta familia en futuras pandemias. Además, la alianza del IRYCIS con Aptus Biotech, startup junto a la que se han licenciado varios aptámeros para su desarrollo y puesta en mercado previamente, permitirá valorizar el proyecto para hacerlo atractivo a empresas farmacéuticas.

Proyecto AVATAR-EPAMEC. Partiendo del concepto AVATAR, representación virtual en entornos computacionales de la identidad real de individuos o comunidades, y siendo EPAMEC las siglas correspondientes a EPidemiological Analysis by MEmbrane Computing, surge este proyecto liderado por el Dr. FERNANDO BAQUERO, IP del Grupo BIOLOGÍA Y EVOLUCIÓN DE MICROORGANISMOS (Área 2 del IRYCIS). El Proyecto pretende una aproximación "multi-purpose" en epidemiología, esencialmente con el objeto de probar "in silico" las posibles intervenciones a adoptar (aisladas o en combinación) y sus efectos previsibles. Asimismo, se propone ampliar el modelo existente de SARS-CoV-2 para incluir la dinámica de ondas epidémicas, resultados de distintos tipos de vacunas, así como la aparición de variantes virales y la introducción de parámetros ya conocidos de epidemias anteriores. Además de la epidemia por SARS-CoV-2, se estudiará la epidemiología de infecciones de gripe y transmisión sexual. Otro de los objetivos consiste en la explotación de datos reales para validar retrospectivamente el modelo, aprovechando los conocimientos en SARS-CoV-2 y viruela del mono, y se iniciaría la validación en gripe. Por último, se pretende que el escalado y difusión de AVATAR-EPAMEC permitirá poner esta modelización a disposición de todos los agentes decisores en materia de Salud Pública y adaptarlo fácilmente para apoyar la toma de decisiones en otros contextos epidemiológicos. El "análisis teórico" en el que se basa el modelo propuesto como Proyecto a desarrollar se presentó en 2021 al Premio "Application of the Year" de la "International Membrane Computing Society" recibiendo el galardón. Asimismo, en la actualidad el proyecto ya ha conseguido resultados aceptados para publicación bajo el título: "Simulating the Efficacy of Vaccines on the Epidemiological Dynamics of SARS-CoV-2 in a Membrane Computing Model" en la prestigiosa revista microLife.