El IRYCIS recibe el premio PRAN 2018 en la categoría de Mejor Iniciativa de Investigación
Los investigadores del IRYCIS Teresa Coque y Fernando Baquero, adscritos al Servicio de Microbiología, y Val F. Lanza coordinador de la Unidad de Bioinformática, recibieron el Premio PRAN 2018 II edición en el Ministerio de Sanidad, Consumo y Bienestar Social, por su trabajo 'Nuevas metodologías metagenómicas y bioinformáticas para la detección y cuantificación de bacterias y genes con resistencia a antimicrobianos: identificación de reservorios y evaluación de riesgos de adquisición y transmisión'.
El acto de entrega de premios estuvo presidido por Faustino Blanco, secretario general de Sanidad, y María Jesús Lamas, directora de la Agencia Española de Medicamentos y Productos Sanitarios -AEMPS- dentro del programa de actos de la Jornada del Día Europeo para el Uso Prudente de los Antibióticos 2019.
Análisis cualitativo y cuantitativo
El trabajo consiste en el desarrollo, validación e implementación de ResCap, la primera plataforma de captura génica aplicada al análisis de resistomas. Representa la primera herramienta metagenómica que permite el análisis cualitativo y cuantitativo de los genes que confieren resistencia a agentes antimicrobianos y la primera aproximación para establecer índices de riesgo de adquirir resistencias a antimicrobianos y para monitorizar los cambios temporales y espaciales en resistomas que se producen en respuesta a intervenciones clínicas y terapeúticas. La elaboración de índices de riesgo de adquisición y transmisión de microorganismos supone un avance necesario para la Microbiología y las Enfermedades Infecciosas del siglo XXI bajo la perspectiva de la Medicina de Precisión.
Cuantificación de metagenomas
Las plataformas de captura génica permiten analizar un gran número de genes ortólogos en cohortes de numerosas muestras y fueron desarrolladas inicialmente para mejorar y acelerar el diagnóstico de enfermedades genéticas humanas, principalmente cáncer. ResCap es una plataforma de captura de más de 80.000 genes que confieren resistencia a antimicrobianos -antibióticos, metales pesados, biocidas-, y biomarcadores de elementos genéticos móviles y permite analizar simultáneamente decenas de miles de genes con una sensibilidad 200 veces mayor que las técnicas metagenómicas disponibles.
El desarrollo y validación de ResCap y de los métodos bioinformáticos para su análisis, se publicó en 2018 en la revista Microbiome (IF-5y 11,4; DOI:10.1186/s40168-017-0387-y), trabajo destacado en los blogs de Nature y de la Joint Programming Initiative on Antimicrobial Resistance (JPIAMR) por su impacto en estudios aplicados sobre microbiomas. Actualmente, ResCap está siendo utilizada en proyectos multdisciplinares en los que participan investigadores y personal del Servicio de Microbiología, el Servicio de Medicina Intensiva del Hospital Universitario Ramón y Cajal, la UCA de Bioinformática, la UCA de Genómica Traslacional y la Unidad de Innovación del IRYCIS. Estos proyectos están financiados por agencias públicas nacionales (ISCIII-PI18/1942) y privadas (Fundación Ramón Areces, 2019-2021). El grupo colabora con otros centros internacionales y empresas para adaptar ResCap a otras tecnologías que permitan una mejor caracterización de comunidades microbianas, en proyectos financiados por la UE (STARCS) y la Comunidad de Madrid (InGEMICS).
Sobre el PRAN y sus objetivos
El PRAN es un plan estratégico y de acción cuyo objetivo es reducir el riesgo de selección y diseminación de resistencia a los antibióticos y, consecuentemente, reducir el impacto de este problema sobre la salud, preservando de manera sostenible la eficacia de los antibióticos existentes. El PRAN se creó en el año 2014 como respuesta a la Comunicación de la Comisión Europea del 17 de noviembre de 2011, que solicitó a los Estados miembros un Plan de Acción sobre Resistencias Antimicrobianas, así como a las Conclusiones del Consejo de la UE del 29 de mayo de 2012, en las que se instó a un abordaje urgente y conjunto de las autoridades sanitarias de todos los países europeos de este problema. La Agencia Española de Medicamentos y Productos Sanitarios (AEMPS) es la coordinadora de todas las actividades del PRAN. El PRAN otorga su premio anual a las mejores iniciativas nacionales en cada una de sus líneas estratégicas de acción: investigación, vigilancia; publicación científica; formación y comunicación.
